智能体使用经验 AutoDock-Vina 分子对接 - 使用 blind docking 快速查找作用区域/蛋白口袋

luorui · 2025年10月09日 · 43 次阅读

使用 AutoDock Vina 盲对接 (blind-docking) 智能体

上传蛋白和配体的 pdb 文件

可以将模式数设置得大一点,比如 30.

查看结果

对接完毕之后,我们直接点击文件

把小眼睛👀全部打开(或者只打开前 10 个或前 20 个模式,越靠前得模式结合力越强)

此时会发现有一些聚集区域,这就是当前配体与蛋白的强作用区域

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