感谢您的反馈，下面尝试对您的问题作出回答：(1) 关于 SCF 不收敛是很常见的问题，除了 Agent 提供的放松收敛判据 (scf_conv_tol 修改为 1e-8) 、增加结构优化圈数 (opt_max_cycle 修改为 200)，以及基组和泛函的修改外，还有其他的方法，但尚未被 Agent 支持，您可在微信搜索这篇文章《PySCF 程序包平均场计算的一些收敛技巧》了解。另外，SCF 收敛与计算体系十分相关，如果体系中含有金属元素，基组的选择是要特别考虑的，起码要足够大。此外，可以对金属元素和其他元素使用不同的基组。至于 config 文件修改失败的问题，目前您可再次尝试，在开发者测试中，并不存在这个问题，之后开发者也会进一步查看导致该问题的原因。(2) Agent 尚不支持限制性结构优化，使用 gpu4pyscf 和 pyscf 进行限制性结构优化，需要撰写 constrain.txt 文件以及使用 geometric 优化器进行优化 (benry 优化器好像不支持限制性结构优化)。您可参照 Github 上的这个 Issue [https://github.com/pyscf/pyscf/issues/2176] 了解。(3) Agent 结构优化后输出的文件，包括三个：(a) log 文件，记录计算过程，不可直接给其他量子化学软件使用；(b) h5 文件，保存了一些计算数据，也不可以被其他软件使用；(c) xyz 文件，包含优化后的结构，应该不能被 Orca 直接使用，但可提取其中的坐标信息撰写 Orca 需要的 .inp 文件。(4) 结构优化并非是执行激发态计算的前提条件，如果您的计算体系是从 XRD 拿到的，建议直接使用当前的结构进行激发态计算。最后，您的建议是十分重要的，在使用过程中，确实有这样的感觉，随着日后 Agent 的完善，会对此作出调整，当前这样设置的一部分原因是使得 Agent 进行明确的操作，以避免产生连串的 (像假想一样的) 错误操作。

在开发者本地部署的版本中，手动修改文件是可以成功做到的，之后，我们会联系其他开发者重新查看这个问题。另外，从您分享的这个 config 文件来看，其中 "basis": "cc - pvdz" 应该会导致计算出问题，应该是 "basis": "cc-pvdz"。

瓦达西瓦，空你吉瓦！

哇！感谢你的反馈！(1) 目前部署的 GPU4PySCF Agent 还不支持周期性边界条件（或者说按材料）计算，但支持分子的计算，比如抽出一个单胞的部分去当作分子算。(2) 对于单重态和三重态的激发能计算 (TDDFT) 是支持的，但是要当作两个任务去进行，一个是算单重态，一个是算三重态；现在 Agent 在执行激发态计算任务时，初始复制过来的"计算条件配置文件" (gpu4pyscf_tddft_config.json)，默认执行单重态计算，如果进行三重态计算，需要将 gpu4pyscf_tddft_config.json 中的 "singlet" 参数改为 false。另外，如果需要计算更多数量的激发态 (默认是 5)，可以同时修改 gpu4pyscf_tddft_config.json 中的 "nstate" 参数。(3) 关于自旋轨道耦合系数计算，目前 Agent 并不支持，ORCA 量子化学软件具备这个功能。(4) a. txt 中读取数据失败，可能是任务实际未能成功执行，这种情况可能连 log 文件也是空白。b. 或者是输入文件的名字解析出问题，现在 Agent 对具有 "-" 的命名处理会有问题，这个问题在整改中，因此暂时建议不要出现含有"-"的命名。c. 还可能是使用的 GPU 的内存不够，因为当前使用 Agent 执行任务，默认使用的是两块 GPU，约提供 45 G 内存，若是这种情况，可缩小计算体系，或者在日后，随着 Agent 发展，使其能根据用户的需要去调配 GPU 数目。此外，用户当前可以通过调整计算条件配置文件的 threads 和 max_memeory 参数设置计算资源。(5) 目前，GPU4PySCF 开发者测试的 TDDFT 的计算尺寸，可以计算上百个原子，但是口述，未有文章报道。已报道的文章是执行单点能、受力和二阶能量导数的计算能力评估，可计算上百原子的体系。